Come giocare tutte le run di Nier Automata?

Ciao a tutti in questo periodo sto giocando Nier Automata (sono ancora alla prima run) e mi stavo chiedendo: cosa devo fare per affrontare tutte le run? Ho letto un po' su internet ma non mi è molto chiaro cosa devo fare. Per esempio, devo fare tutte le missioni secondarie o basta fare solo la missione "il coraggio di Emil" per sbloccare il finale segreto della quarta run? E in generale, è necessario fare tutte le missioni secondarie?